Du fait de sa situation en rivière et de ses écluses, ce port subi un envasement d'environ 7000m3/an lié aux sédiments transportés du bassin versant, qui se déposent dans le bassin portuaire.

Depuis 2001, 6000m3 de vases étaient dragués et rejetés dans la rivière chaque année, en aval des écluses.
Toutefois, au vu des nombreuses interrogations et oppositions que suscitaient cette méthode auprès des professionnels de la mer, mais également de l'envasement du chenal, Morlaix Communauté a pris le parti de rechercher une solution alternative au rejet en rivière.

 

Pour cela, elle mène une action en plusieurs phases :

1.En 2008, Morlaix Communauté a recherché la technique de dragage la plus adaptée aux caractéristiques physiques, environnementales, socio-économiques et financières du port de Morlaix. Le bureau d'études IN VIVO ENVIRONNEMENT a été recruté pour l'identification d'une solution alternative au rejet en rivière.

Un comité de pilotage largement ouvert regroupant élus, État, chambres consulaires, syndicats mixtes de gestion des eaux, plaisanciers, l'IFREMER et l'association Bretagne Vivante a été constitué pour suivre cette étude et sa mise en œuvre technique ultérieure.

Ce fonctionnement a permis de lancer le désenvasage du port en mai 2009, avec dépôt à terre de 15 000m3 de sédiments.

2.De manière à limiter les transports de sédiments, la recherche des zones les plus sensibles à l'érosion et produisant le plus de sédiments dans le port a commencé en juin 2009.

3.Des études seront menées prochainement pour trouver un aménagement du bassin à flot permettant de limiter la sédimentation dans le port.